Снятый в Сауз Бич, Майами, "Части тела" проникает глубоко за пределы кажущегося простым мира пластической хирургии, обнажая сложность и хрупкость пациентов, пытающихся замаскировать свои психологические трещины через косметические усовершенствования.

Самоуверенный пластический хирург доктор Кристиан Трой наслаждается успешно расширяющейся практикой, которую он делит с лучшим другом, доктором Шоном МакНамара с самого окончания медицинской школы. Доктор Лиз Круз работает анестезиологом. Несмотря на то, что Кристиан иногда использует богатство и женщин для удовлетворения своих все растущих потребностей, годы такого имиджа оказали непосредственное влияние на Шона, отношения которого с женой Джулией и детьми, семнадцатилетним Мэттом и восьмилетней Энни, находятся под угрозой краха.

Шон неохотно справляет свой сороковой день рождения, Кристиан толкает его попробовать преимущества омолаживающих процедур, доступных в клинике. Однако Шон хочет стареть в своем натуральном виде. Тем не менее, неожиданные спазмы у Шона во время деликатной операции заставляют его пойти к неврологу.

В это время, после неожиданного провала попытки назначить свидание в баре сексуальной молоденькой девушке, Кристиан осознает свой дискомфорт по поводу того, что он мало что может сделать для остановки процесса старения. Несмотря на то, что он не является отцом, Кристиан соглашаться растить ребенка бывшей подружки Джины Руссо, и это заставляет его сделать переоценку ценностей и жизненных приоритетов. Оба доктора имеют дело с неожиданным визитом самовлюбленной матери Джулии, Эрики Нофтон, требующей омолаживающей пластической операции.

Также, доктора проводят реконструкцию лица молодой женщины, которая якобы нечаянно выстрелила в себя будучи в нетрезвом состоянии. Однако потом Шон заставляет её рассказать шокирующую правду, пациентка принимает сильнодействующие наркотики.

Шон страдает от бесконтрольных спазмов в руке. После того как он задевает главную шейную артерию пациента во время обычного удаления кисты, Шон перестает оперировать. Он оказывается в ещё большей депрессии, когда Кристиан, чей нос был разбит женщиной во время секса, просит постороннего хирурга вправить его. Кристиан глубоко поражен, когда привлекательная хирург не только противостоит его сексуальным напорам, но и советует сделать несколько косметических операций на его стареющем теле.

Шон в конце концов выходит из себя, когда кто-то блокирует его машину на парковке. Джулия, по совету своей матери, помогает Шону понять, что она будет любить его даже если он уйдет из медицины. После неудачной попытки прооперировать самого себя с помощью зеркала, Кристиан возвращает Шону уверенность в себе, говоря, что доверяет сделать это только ему.

А в это время, прошлое Мэтта снова проявляется, когда девушка, сбитая им в прошлом году, изнасилована его, обычно застенчивым, другом Генри. Несмотря на то, что девушка оправилась после аварии и даже простила Мэтта, мальчики сохранили этот секрет в тайне от всех. Но Генри, находящемуся по давлением оставаться идеальным ребенком для своих родителей и учителей, очень нравится девушка и он насилует её. Он рассказывает полиции историю Мэтта с девушкой, надеясь смягчить своё наказание. Пока Мэтт не дал присягу, Шон и Джулия уверяют его, что они на его стороне, несмотря на всю правду. Но Мэтт принимает шокирующее решение.

Кристиан и Шон соглашаются провести реабилитацию здоровой оптимистично настроенной женщине из Сомали, Мании Мабике, чьи половые органы были изуродованы в её родной стране, когда она была девочкой. После хирургического восстановления клитора, Мания просит Кристиана помочь ей испытать оргазм, но даже ему это не удается, заставляя докторов думать, что операция была безуспешной. Тем не менее, с помощью добрых слов и ободрения от Лиз, Мания понимает, что может испытать сексуальное удовольствие. Шон и Кристиан также делают пересадку волос на теле белого мужчины, который в ярости обнаруживает, что донором волос был черный мужчина.

В это время Джулия признается Шону, что тот больше не удовлетворяет её в сексуальном плане. После встречи с Авой Мур, Джулия понимает, что визит её матери, доминирующей Эрики Нафтон, нервирует её. После непродуктивного разговора и долгих аргументов, она приказывает матери уехать, что позволяет Джулии расслабиться и вновь наслаждаться сексом с Шоном - она понимает, что мысли о сексе с Кристианом помогают ей в постели с мужем. Кристиан чувствует удовлетворение от новой роли отца и хочет оформить легальное отцовство над сыном Джины. Он просит Джулию помочь ему растить мальчика.

Шон и Джулия в шоке, когда узнают, что их восьмилетняя дочь Энни уже вступила в возраст половой зрелости. Страдая от собственных возрастных проблем, они пытаются объяснить девочке, что же с ней происходит. Джулия готовит своей семье здоровый, но странный ужин, который должен улучшить их духовное состояние, но Мэтт отказывается есть и расстраивает Энни, делая неприятные замечания по поводу её менструации. Позже, Шон и Джулия со страхом думают, что у Энни пищевое отравление, и привозят её с высокой температурой и бредом в скорую помощь. Но настоящая проблема Энни оказывается намного страшнее. Джулия представляет свою новую подругу Аву Мур Мэтту, надеясь, что она поможет тому преодолеть бурные эмоции.

В это время Кристиан встречается с биологическим отцом ребенка Джины, благородным, женатым и в возрасте черным мужчиной, Джеймсом Сазерлэндом, который был с ней всего одну ночь. Джина просит его принять отцовство ребенка, но Джеймс понимает, что сексуальная озабоченность Джины и другие её проблемы делают её непригодной матерью и обещает помочь с усыновлением Кристиану. Кристиан также имеет дело со своей бывшей подругой и пациенткой Кимбер, пытаясь остановить её от вмешательства в дело против Джины. Однако, ничто не может подготовить Кристиана к тому, что Джеймс изменит своё мнение.

Когда хроническая пациентка Хедда Грабман возвращается с очередным требованием, Шон и Кристиан отказывают ей в дальнейших операциях. Однако потом сжаливаются, когда она говорит им, что её дочь больна раком и она сама должна выглядеть молодой и бодрой, чтобы оказать достойную поддержку. Согласившись на проведение последней операции, доктора испытывают огромные проблемы с перенапряженным телом миссис Грабман.

Пока Джулия наслаждается дружбой с Авой Мур, Мэтт также прогрессирует в работе над своими чувствами с помощью Авы - особенно когда она снимает блузку как часть доверительного упражнения. Но когда Мэтт позже оказывается арестованным за публичное проявление похоти за окном Авы, Кристиан ругается с Джулией из-за того, через что она заставляет пройти Мэтта. И Ава делает вывод о поразительном секрете между Кристианом, Джулией и Мэттом. Также, Мэтт наконец признается Аве о своей вине в происшествии с Карой.

В то же время, необычный альянс формируется между анестезиологом Лиз, лесбиянкой, мечтающей забеременеть, но не имеющей возможности найти подходящего донора спермы, и неудовлетворенным Кристианом, который очень скучает по роли отца. Шон чувствует себя виноватым после того, как стареющая пациентка, Бобби Бродерик, полностью не осмысливает результат липосакции и принимает близко к сердцу последствия. Доктора "делают" новые губы для красивой пятидесятилетней жертвы пожара, чей муж - очень набожный сицилиец шокирован тем, какая часть тела пошла в качестве донорской.

Раздраженная бывшая пациентка Бобби Бродерик, угрожая судебным иском, отпугивает клиентов и пытается убедить репортёра провести расследование того, что она считает противозаконным деянием. В это же время, Шон и Кристиан дали обязательство многообещающей модели, чье лицо было изуродовано серийным маньяком. Они приглашают её и делают операцию бесплатно. Виновато и с неохотой следуя плану, инициированному Кристианом, Шон также убеждает жертву разрешить запись операции для новостей, чтобы прекратить клевету Бобби. Но когда Бобби появляется во время записи постоперационного интервью, ситуация оборачивается неожиданно.

В это время Ава продолжает страстные постельные отношения с семнадцатилетним Мэттом, которые также знакомится с её сыном-невротиком того же возраста. Но даже Мэтт становится вовлеченным манипулирующим поведением Авы и её сына, которые придя на обед уверяют Джулию, что отношения между ними только ученик/учитель, и вечер превращается в катастрофу. Последнее действие Авы направлено на раскрытие секрета Мэтта, который может разрушить семейство МакНамара навсегда.

Испуганная безличностной атмосферой клиники оплодотворения, Лиз просит Кристиана оплодотворить её в более дружественной обстановке.

Когда бездомная проститутка, Агата Рипп, приходит в МакНамара/Трой, доктора думают, что она просто хочет удалить шрамы на её запястьях. Но она говорит Кристиану и Шону, что она - предмет поклонения одного церковного прихода, потому что её шрамы имеют сходство со стигматами, ранами, полученными Христом на распятии. Она просит подтвердить всем, что она нанесла эти раны сама и она не духовный лидер. Но когда церковный служитель и монахиня пытаются забрать её из клиники - и еще больше ран появляется - Шон и Кристиан, оба атеисты, оказываются в плену суеверий, которые меняют их взгляд на веру. Пытаясь найти ответ на вопросы о ситуации Агаты, Шон испытывает сильный личностный кризис.

А в это время, после объявления Лиз беременности от донорской спермы Кристиана, сам Кристиан пытается принимать участие в решениях относительно ещё нерожденного ребенка. Но когда возникают проблемы с беременностью, Лиз принимает независимое решение сама.

Жизнь Шона разрушена после того как он узнаёт, что Кристиан является биологическим отцом Мэтта, согласно тесту, сделанному Джулией. Он выгоняет Джулию из дома и отказывается продолжать партнерство с Кристианом. Но эти двое отчаявшихся мужчины должны ехать в командировку в Нью-Йорк для операции по разделению сиамских близнецов Роуз и Равен Розенберг, операция над которыми может войти в историю.

Поскольку операция проводится ради общественного блага, необходимые условия отсутствуют, и доктора вынуждены находится в общей комнате, как они делали в колледже, это отражается на их отношениях. После шокирующих последствий страшной операции и других событий во время путешествия, они приходят к нелегкому решению насчет будущего Макнамара/Трой.

А в это время, Мэтт пытается справиться с болью от беспорядка в семье, продолжая встречаться с Авой, беспокоя этим Джулию, Шона и Кристиана.

После некоторых трений и решения продолжить их партнерство Шон и Кристиан консультируют богатого журналиста, Айка Коннорса, который хочет для себя грудные имплантанты. После наблюдения за любимой женой, Эми, страдающей от рака груди, вставив имплантанты после удаления одной груди, Айк хочет испытать то же на себе и жить с женской грудью в течении нескольких лет, во время которых он будет писать книгу о своем опыте, доходы от который он пожертвует в Раковый Центр.

Оба доктора по этическим причинам отказывают в операции, но Лиз убеждает их, что лучше помочь кому-то, кто ищет просвещения вместо удовлетворения своего эго, как большинство пациентов. После вставки Айку достаточно больших имплантантов, доктора ошеломлены неожиданной реакцией Эми. Когда позже Айк требует удалить имплантанты, доктора удивлены, но опять только Лиз понимает, что происходит.

В это же время, бывшая подружка Кристиана, Кимбер Генри, возвращается. Она оказалась вовлечена в порнографический бизнес и убеждает Шона создать секс-куклу - своё подобие. Во время совместной работы, одинокий Шон оказывается в неожиданно хороших отношениях с Кимбер, которая стала сильнее и увереннее в себе после разрыва с Кристианом.

Джулия, опустошенная кончиной брака с Шоном, делает попытку вновь найти себя.

Пока доктора работают совместно с экспертом-окулистом по созданию глазных имплантантов для красивой слепой женщины, Наташи Чарльз, Кристиан обнаруживает себя под влиянием прямой и обезоруживающей чувствительности Наташи.

Когда Наташа назначает свидание мужчине, с которым познакомилась через интернет переписку, Кристиан беспокоится, что она попадет под влияние эгоистичного мужчины, как он сам - но его притяжение к ней растет, Кристиан обнаруживает, что невозможность использовать его внешность для получения того, чего хочет, ставит его в уязвимую позицию.

В то же время, Шон продолжает встречаться с моделью Кимбер Генри и с презрением отвергает все примирительные жесты Джулии. С обиженным Мэттом, который теперь живет с Авой, и Энни, остающейся в доме Шона, Джулия чувствует, что теряет контроль, и даже визит её матери Эрики не помогает. Перед тем как покинуть город, чтобы сфокусироваться на своей карьере, Эрика виновато пытается убедить Шона и Кристиана вмешаться в процесс саморазрушения Джулии - но Джулия принимает жизненно важное решение, которое приводит к неожиданным последствиям.

Также, Шон соглашается сделать операцию по уменьшению груди стеснительной девочке 13-ти лет. Однако, когда он узнает истинную мотивацию матери девочки, он жалеет о сделанном.

После принятия большого количества обезболивающих вперемешку с алкоголем, Джулия падает сквозь стеклянную дверь и серьезно повреждает своё лицо. Сначала Шон отказывается оперировать её, всё ещё обиженный тем, что она пошла к другому хирургу для грудных имплантантов. Но зная, что он самый лучший доктор в городе и наконец позволяя себе немного симпатии к эмоционально распадающейся жене, Шон соглашается. Он и Кристиан приводят лицо Джулии в порядок, и, по её просьбе, удаляют имплантанты. Под действием анестезии, Джулии снится, что Ава показывает ей другое измерение, в котором Джулия не уходит от Кристиана после их ночи в колледже.

Вместо того чтобы выбрать Шона, пожертвовать карьерой ради детей и семьи и жить с сожалением, Джулия выходит замуж за Кристиана и становится его партнером в очень успешной медицинской клинике. На поверхности - то, что она всегда хотела.

Узнавая путь, по которому она могла бы пойти и эффект, который это произвело бы на других - Мэттта, Лиз, Эрику, Кимбер и Шона с Кристианом - она делает удивительные открытия о себе и своей неизбежной судьбе.

Когда бедная латиноамериканка приезжает в офис Шона и Кристиана с ужасными волдырями на лбу, доктора узнают, что их старый коллега, Мэррил, делает дешевые нелегальные операции на бедных людях.

Чувствуя свою вину в том, что Боболит потерял лицензию и был вынужден делать нелегальные операции, Кристиан следует за ним и обнаруживает, что операции проводятся в задней комнате маникюрного салона. Кристиан пропускает встречу с Боболит из-за операции, что приводит к ужасным последствиям для него и его пациента.

А в это время, Мэтт теперь ходит в школу вместе с Эдрианом, сыном своей любовницы Авы Мур. Когда Эдриан попадает в неприятности из-за продажи наркотиков своей матери в школе, Мэтт также оказывается вовлечен. Ава убеждает Мэта попросить Кристиана прийти на конференцию "Родители-Учителя" вместо Шона и предложить бесплатное удаление морщин вокруг глаз взамен на снисхождение к мальчикам.

Тем не менее, Эдриан попадает в неприятности во второй раз, Шон узнает об этом и наперекор Аве устанавливает жесткие запреты для Мэтта - с неожиданными последствиями.

Шон и Кристиан берутся за дело Труди Нии, которая хочет исправить свой нос. Много лет назад, её муж разбил ей нос - а в тот же день он в припадке ярости убил их маленького сына. Сейчас он выходит из тюрьмы раньше срока. Доктора думают, что Труди хочет оставить прошлое позади и забыть боль от своего замужества. Но когда наивная Труди возвращается в сопровождении своего мужа, которые клянется, что невиновен и просит провести операцию и для него, доктора должны принять трудное решение.

В то же время, отношения Кристиана со слепой Наташей развиваются хорошо. Интрижка Шона с Кимбер заходит в тупик, когда она начинает слишком сильно от него зависеть, ему невыносимо видеть, как счастлива Джулия со своим новым другом - инструктором по теннису Кевином Хотчкисом. Шокирующие открытия об Аве и её сыне, Эдриане, заставляют Джулию и Шона объединиться против неё и предпринять попытку освободить Мэта из под её влияния.

Шон проводил показательную операцию на жертвах Скульптора, серийного насильника и убийцы, который выбирал хорошо выглядящих людей и отрезал им куски лица как послание человечеству о красоте. После исправления лица молодого человека-модели, последней жертвы маньяка, Шон привлекает внимание женщины-репортера. Но телевизионная передача о Шоне имеет ужасные последствия.

В это же время, уже сожалея о выборе, Кристиан получает новости, которые влияют на него лично и на его профессиональную жизнь. Сын Авы исчезает с таблетками матери. Все еще влюбленный в Аву, Шон тонет еще больше в её мире.

Знаменитость Джоан Ривз, знаменитая из-за многочисленных пластических операций, консультируется у доктора. Тем не менее, запрос Джоан поражает Шона и Кристиана.

Также, Шон, Кристиан и Джулия узнают шокирующую правду об Аве - этого достаточно, чтобы уничтожить её жизнь и вернуть Мэтта.

Шон принимает решение о том, что делать со Скульптором.